测序新技术提供基因表达高精数据
近期,日本东京理科大学的一支研究团队成功研发了一种全新的单细胞RNA测序技术终止子辅助固相互补DNA扩增和测序(TAS-Seq)。这一技术的问世,为医学和生物学领域带来了重大的突破。与传统的单细胞RNA测序方法相比,TAS-Seq技术在遗传检测灵敏度、反应效率稳健性以及细胞组成准确性等方面具有显著优势。这项创新成果已经发表在《通讯生物学》杂志上。
单细胞RNA测序技术的诞生,为研究者们提供了研究数千个细胞内部工作的能力,具有革命性的意义。传统的单细胞RNA测序方法在确定细胞成分方面存在潜在的不准确性和低效的cDNA扩增问题。为了解决这些问题,研究团队不断深入研究,最终研发出了TAS-Seq技术。
该技术通过运用一种称为末端转移酶(TdT)的模板独立酶进行cDNA扩增。尽管处理TdT存在一定的挑战,但研究团队巧妙地利用双脱氧核苷酸磷酸(ddNTP)作为cDNA扩增反应的“终结者”,极大地简化了TdT反应的技术难度。这不仅提高了cDNA扩增的效率,还增强了测序的准确性。
TAS-Seq技术还采用了基于纳米孔的单细胞RNA测序平台。这一平台能够精准地分离组织样本中的单个细胞,有效减少细胞采样偏差,提高了细胞组成数据的准确性。研究团队通过验证发现,与传统的单细胞RNA测序技术相比,TAS-Seq不仅检测到更多的整体基因,还能识别更多高度可变的基因。
该研究的领导者七野诚之助理教授表示,“我们发现TAS-Seq在基因检测灵敏度和基因丢失率方面可能优于其他主流的单细胞RNA测序方法。这一发现表明,TAS-Seq可能是最灵敏的高通量单细胞RNA测序方法之一。”他还进一步透露,团队已经完成了对TAS-Seq的升级版TAS-Seq2的开发,其基因检测灵敏度更高,有望在空间转录学领域取得更多进展。
单细胞RNA测序技术是医学和生物学研究的重要工具,而TAS-Seq和TAS-Seq2的开发将无疑引领这一领域的进步。它们不仅将促进新的疾病治疗靶点的发现,还将推动单细胞组学技术的发展,帮助人们更深入地了解生物学和疾病发生发展的原理。这些创新技术将在未来的医学研究中发挥越来越重要的作用。